Воспитанник астраханских клуба "Локомотив" и школы "Смена". Выступал за клубы "Волгарь" Астрахань (1972 - 1974), "Крылья Советов" Самара (1975 - 1976, 1989 - 1993), "Торпедо" Москва (1977 - 1985), "Динамо" Москва (1986), "Спорт" Таллин (1987 - 1988), "Лада" Тольятти (1989), "Нефтехимик" Нижнекамск (1993). Обладатель Кубка СССР 1986 г. За сборную СССР сыграл 15 матчей. За олимпийскую сборную СССР сыграл 4 матча.
Тренер в клубе "Локомотив" Нижний Новгород (1994 - 1996). Тренер в ФШ "Торпедо-ЗИЛ" Москва (1997 -2002). Тренер в клубе "Волгарь-Газпром" Астрахань (2003).
Так уж сложилось, что на протяжении всей своей более чем 60-летней истории "Крылья Советов" вынуждены были придерживаться оборонительной тактики игры, в которой большая часть нагрузки падала на вратаря и защитников. Многое зависело от мастерства и сыгранности защитников. Поэтому поклонники "Крыльев Советов" всегда ценили игроков обороны, многих из них просто боготворили. Заметный след в истории самарского футбола оставили Виктор Мурзин, Александр Скорохов, Иван Ширяев, Геннадий Сарычев, Геннадий Сахаров и др. Позже их славные традиции продолжил Василий Жупиков.
Центральный защитник Василий Жупиков был одним из ведущих игроков "Крыльев Советов" на протяжении длительного времени. Первой командой мастеров для Василия Жупикова стал родной астраханский "Волгарь", где он дебютировал в 17-летнем возрасте в 1971 году правым защитником под руководством Юрия Белоусова. Тогда он выступал вместе с ветераном самарского футбола Евгением Гецко. В "Крылья Советов" был приглашен в 1975 году Виктором Киршем. Дебютировал в нашей команде 11 апреля 1975 года в Душанбе против "Памира" (1:1). Первый свой гол за "КС" забил 10 октября 1975 года в Орджоникидзе "Спартаку". С первых матчей стал любимцем болельщиков "КС", играл смело, тактически грамотно, выделялся трудолюбием и строгим соблюдением игровой дисциплины. Физически сильный, выносливый, он хорошо играл головой, отличался быстротой реакции, умело действовал на последнем рубеже, владел сильным ударом. Всегда играл самоотверженно, с полной самоотдачей. Эти качества плюс хорошая техническая оснащенность привлекли к Василию Жупикову внимание тренеров высшей лиги, где он также был в лидерах. В московском "Торпедо" стал мастером спорта, поиграл в еврокубках.
В "Крылья Советов" он был вновь приглашен осенью 1989 года, когда команда боролась за возвращение в первую лигу. 35-летний центральный защитник "КС" отличался цепкостью, жесткостью в единоборствах, выносливостью и умелым взаимодействием с молодыми партнерами. Техничный, уверенный в себе, он был столпом обороны "КС", ее надеждой и опорой, пользовался большим авторитетом в команде. В 1974-1975 и 1989-1993 годах сыграл в чемпионатах страны за "КС" 173 матча, забил 3 мяча, в т. ч. в высшей лиге – 60 матчей.
Строгое соблюдение спортивного режима, серьезное отношение к тренировкам позволили Василию Жупикову играть долго. Последний матч за "КС" он провел в Нижнем Новгороде против местного "Локомотива" 2 мая 1993 года в возрасте 39 лет, 3 месяцев, 16 дней. Только Андрей Ржевцев играл за "КС" в более старшем возрасте (39 лет, 7 месяцев, 23 дня). Тонкое понимание игры, умелое обращение с мячом, мобильность и трудолюбие надолго сделали его кумиром самарских болельщиков. Недаром Василий Жупиков включен в число 33-х лучших футболистов "КС" за всю их историю. Ему присущи качества лидера, свою игру всегда подчинял интересам команды. Его называли стержневым игроком оборонительной линии – бесстрашно вступая в борьбу с любым форвардом, он действовал жестко, но корректно. Многие прославленные нападающие в единоборствах с Василием Жупиковым теряли свои лучшие качества.